Отдел в своей деятельности руководствуется

• Законодательством РФ;
• Уставом ФГБУ «Национальный парк «Алханай»;
• Положением о национальном парке «Алханай»;
• Локальными актами учреждения;
• Нормативными актами по охране труда, производственной санитарии, противопожарной защиты, экологической безопасности;
• Положением об отделе государственной инспекции в области охраны окружающей среды ФГБУ «Национальный парк «Алханай».                                   

В составе отдела работают 27 сотрудников. Отделом руководит первый заместитель директора — Аюров Б.Б.

Государственные инспектора при проведении мероприятий по контролю на особо охраняемой природной территории имеют право:

1. запрашивать в целях проверки у граждан, находящихся на территории национального парка, разрешение на право пребывания на указанной особо охраняемой природной территории;
2. запрашивать в целях проверки у юридических лиц, индивидуальных предпринимателей документы на право осуществления природопользования и иной деятельности на прилегающих к землям национального парка территории охранных зон;
3. задерживать на территориях национального парка и их охранных зон граждан, нарушивших законодательство Российской Федерации об особо охраняемых природных территориях, и доставлять указанных граждан в правоохранительные органы;
4. производить на территории национального парка и их охранных зон досмотр транспортных средств, личных вещей граждан;
5. изымать у граждан, нарушивших законодательство Российской Федерации об особо охраняемых природных территориях, продукцию и орудия незаконного природопользования, транспортные средства и соответствующие документы;
6. при исполнении служебных обязанностей применять специальные средства — наручники, резиновые палки, слезоточивый газ, устройства для принудительной остановки транспорта, служебных собак.

Отдел делится на 4 подразделения: Алханайское участковое лесничество, Ара-Илинское участковое лесничество, Краснояровское участковое лесничество, оперативный отдел.